விண்ணப்பம் சமர்ப்பிக்கப்பட்ட பிறகு, சம்பந்தப்பட்ட பிராந்திய அலுவலர்கள் ஆய்வு கட்டணக் கடிதத்தை அனுப்புவார்கள். கட்டணம் செலுத்திய பிறகு, பிராந்திய அலுவலர்கள் கழிவு நீர் முகாமைத்துவ முறைகளை ஆய்வு செய்து, விண்ணப்பத்தில் உள்ள தகவல்களைச் சரிபார்ப்பார்கள்.

ஆய்வுக்குப் பிறகு, மாவட்ட கடல் சூழல் அலுவலர் பரிந்துரை செய்யும் அறிக்கையைத் தயாரிப்பார். இதை உதவி மேலாளர் (Assistant Manager – AM) மதிப்பீடு செய்ய, அதன் பின்னர் MEPA தலைமையகத்திற்கு ஆன்லைன் முறையில் அனுப்பப்படும்.

கடல் கழிவு அனுமதி மதிப்பீட்டு குழு (Evaluation Board for Dumping Permits) ஆவணங்களை மதிப்பீடு செய்து பரிந்துரைகளை உருவாக்கும். கணினி முறையில் ஆண்டின் நீர் பயன்பாடு மற்றும் கழிவு நீர் உற்பத்தியை கணக்கிடும்.

மதிப்பீட்டுக்குப் பிறகு, விண்ணப்பதாரருக்கு கட்டண தகவல் கடிதம் அனுப்பப்படும்.

கட்டணம் செலுத்தப்பட்டவுடன், ஆண்டிற்கான கடல் கழிவு அனுமதிப் பத்திரம் (Annual Sea Dumping Permit) பொதுமுகாமையாளர் (General Manager) கையொப்பமிட்ட நிலையில், அஞ்சல் மூலம்வழங்கப்படும்.

அனுமதிப் பத்திரம் ஒரு ஆண்டுக்கு செல்லுபடியாகும். காலாவதியாகும்முன் மூன்று மாதங்களுக்கு முன்னதாக புதுப்பித்தல் செயல்முறையை தொடங்க வேண்டும்.